O PPG em Engenharia Elétrica e Computação esta administrativamente ligado a duas Unidades Acadêmicas da UPM: Escola de Engenharia (EE) e Faculdade de Computação e Informática (FCI).
A Coordenação do Programa é alternada por um docente de cada uma das áreas de concentração do Programa. A gestão no quadriênio 2025-2028 está sob a responsabilidade da EE que por meio de indicação da direção da unidade, ouvida as instâncias superiores como Pró-Reitoria e Reitoria, nomeou o Prof. Paulo José de Aguiar Simões como coordenador neste período.
Por questões regimentais a UPM não tem Vice-Coordenador(a) em seus Programas de Pós-Graduação, mas a Profa. Lúcia Akemi Miyazato Saito, representante docente da área de Engenharia de Telecomunicações, tem assumido o papel de eventual substituta durante este quadriênio.