A Coordenação de Lato Sensu é responsável por propor, acompanhar e avaliar cursos de especialização, comumente conhecidos como curso de Lato Sensu. Cursos de Lato Sensu são realizados com o requisito mínimo de uma graduação. Atualmente, a FCI possui cursos de Lato Sensu que cobrem áreas avançadas de Sistemas e Computação, que podem ser feitos presencialmente na Universidade Mackenzie ou organizados in Company. Há dois processos seletivos anuais para estes cursos: Junho/Julho e Novembro/Dezembro/Janeiro.