Esta Secretaria, vinculada à Reitoria, incorpora as competências funcionais da Coordenadoria de Processos e Controles Acadêmicos, e tem como atribuições:

• Coordenação das atividades acadêmico-administrativas, normativas e Solenidades Especiais dos Conselhos Superiores;
• Registro, representação acadêmico-institucional e controle das Solenidades de Colação de Grau;
• Gestão de processos acadêmico-administrativos de Controle Acadêmico.

Estão integradas à SECCA as seguintes áreas:

• Coordenadoria de Processos Seletivos (CPS);
• Coordenadoria de Acervo Acadêmico, Registro de Diplomas e Documentos (CARD);
• Procuradoria Acadêmica Institucional (PI). 

Em síntese, este é o setor responsável pela manutenção e controle dos registros acadêmicos de todos os alunos da UPM. As matrículas inicial e subsequentes, o controle de frequência e de notas, a colação de grau, a assinatura de diplomas e documentos, entre outras responsabilidades são atribuições dessa Secretaria.